影响洁净实验室内空气流动的因素很多，例如工艺设备、人员、洁净室装配材料、照明用具等。同时，还应考虑生产设备上方气流的分配点。一般操作台或生产设备表面的气流分配点应位于洁净室空间与隔板之间的距离，以便操作人员工作时，气流可从加工区域内部流向操作区域，并可将灰尘带走。如果将分流点设置在加工区域的前面，就会成为一种不适当的气流分流，此时大部分气流会流向加工区域，操作人员操作所造成的粉尘将被带到设备的后面，工作台将受到污染，良好的风量不可避免地会降低。洁净室的工作台等障碍物会在下一个地方产生漩涡现象，附近的清洁度也会比较差。在工作台上钻回风孔会将涡流现象降到比较低；装配材料的选择是否合适，设备布置是否完善，气流是否已成为涡旋现象的一个重要因素。
洁净实验室布局时需考虑消防疏散走廊满足规范要求 按规范要求设置水消防系统，喷淋可考虑采用预作用式喷淋系统，以免误喷导致设备的损失。 控制试剂存放总量，选用带排风的试剂存放柜。 如有氢化反应，宜单独设置，面积控制到小，布置在建筑端头，按防爆区域设计，并考虑足够的泄压面积及门斗。 实验区设紧急冲淋和洗眼器等人身防护安全措施。 与活性菌种接触的物品及人员应考虑除菌措施，做好生物安全防护工作。 药厂的质量检验中心布置主要由以下功能间组成：① 样品收集；② 样品记录和分发；③ 样品分析；④ 试剂存放间；⑤ 清洗、干燥间；⑥ 培养基制备；⑦ 高压除菌 ；⑧ 会议室 ；⑨ 资料档案室 ；⑩ 员工办公室和洗手间。留样间、分析辅助功能间（包括天平室、精密仪器室、标准品配制间等）、公用工程辅助功能间（包括气瓶间、制水间、配电间、空调机房等）
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